UPDATE Fornecedores
SET
	CPF = CPFCorrigido,
	CGC = CGCCorrigido

FROM
	(	SELECT 
			Código AS ID,
			(CASE CPF WHEN '' THEN CPF ELSE SUBSTRING(CPF,0,4) + '.' + SUBSTRING(CPF,4,3) + '.' + SUBSTRING(CPF,7,3) + '-' + SUBSTRING(CPF,10,2) END) AS CPFCorrigido,
			(CASE CGC WHEN '' THEN CGC ELSE SUBSTRING(CGC,0,3) + '.' + SUBSTRING(CGC,3,3) + '.' + SUBSTRING(CGC,6,3) + '/' + SUBSTRING(CGC,9,4) + '-' + SUBSTRING(CGC,13,2) END) AS CGCCorrigido
		FROM 
			Fornecedores
		GROUP BY
			Código,
			CPF,
			CGC) as Fornecedor
WHERE
	Código = Fornecedor.ID